El Gobierno de José María Aznar habría dado 150.841,22 euros en ayudas públicas a la Fundación Francisco a Franco entre el año 2000 y el 2003 en concepto de desarrollo de proyectos archivísticos y difusión de su patrimonio documental. Así lo ha confesado el propio Ejecutivo al remitir estos datos a los diputados de En Marea Antón Gómez-Regne y Yolanda Díaz, después de que en enero preguntaran al Congreso la cuantía de las ayudas públicas percibidas por esta entidad desde su fundación.
Ahora, el Gobierno de Mariano Rajoy asegura que "no ha recibido ninguna subvención en régimen de concesión directa", pero sí estas ayudas para microfilmaciones. Ayudas que concedió el Ejecutivo de Aznar acogiéndose a las convocatorias anuales de libre concurrencia previstas por las entidades privadas sin ánimo de lucro.
El año 2000 habría recibido 41.080,38 euros, mientras que en 2001 las ayudas se subieron hasta los 42.070,84 euros. Las dos en concepto de proyectos archivísticos y de conservación y difusión de patrimonio documental. Los dos años siguientes sólo habría recibido subvenciones por el primer concepto, los archivos, dando en 2002 ayudas de 23.000 y 18.000 euros, mientras que en el 2003 la cantidad bajó hasta los 26.690 euros.
Con la llegada de José Luís Rodríguez Zapatero al Gobierno, estas ayudas habrían cesado, y ya no se habrían dado más.