La reina emèrita Sofia guarda un profund afecte per tots els seus nets. El seu anhel més gran és veure'ls novament units, compartint un dinar familiar com en els vells temps. Tanmateix, fa ja més de deu anys que no es produeix una reunió completa dels vuit. Les tensions dins de la família, en especial per part del rei Felip VI i la reina Letícia, han impedit que les seves filles, la princesa Elionor i la infanta Sofia, coincideixin amb certs cosins, marcant una clara divisió.
Sofia sempre ha tingut un vincle especial amb tots els seus nets, encara que la seva proximitat varia segons el cas. Mentre que el rei Joan Carles mostra una forta afinitat amb Froilán i Victoria Federica, ella ha desenvolupat una connexió més profunda amb els fills de la infanta Cristina. En moments difícils, com quan va esclatar l'escàndol del cas Nóos, la reina emèrita va ser un suport clau per a la seva filla Cristina, especialment quan aquesta va haver de mudar-se amb els seus fills a Washington i després a Ginebra.
La reina Sofia, molt crítica amb els matrimonis homosexuals
No obstant això, l'harmonia es va trencar quan el més gran dels nets, Juan Urdangarin, li va presentar a la seva parella sentimental, un jove amb qui manté una relació des de fa uns tres anys. D'acord amb fonts citades per Informalia, aquest fet va causar cert distanciament entre àvia i net, ja que la relació homosexual del jove no encaixa amb la visió tradicional i conservadora que manté l'exmonarca.
En el passat, Sofia ja havia estat objecte de crítiques per les seves opinions sobre les persones LGTBIQ+. Segons una biografia no oficial escrita per la periodista Pilar Urbano, la reina va expressar incomoditat davant certes manifestacions del col·lectiu. Comentaris com que no comprenia l'orgull de mostrar públicament l'orientació sexual o que s'hauria d'utilitzar un terme diferent del de "matrimoni" per a les unions entre persones del mateix sexe, van generar una forta polèmica. Davant de la controvèrsia, la Casa Reial va negar que aquestes declaracions fossin verídiques i va emetre un comunicat oficial desvinculant la reina de tals paraules.
Durant el seu regnat, també es deia que no es permetia la contractació d'homes homosexuals dins del seu entorn proper, encara que això mai es va confirmar públicament per temor de conseqüències. Aquesta postura ha generat tensions fins i tot dins de la seva família, ja que la infanta Cristina, mare de Juan, ha defensat obertament al seu fill i el seu dret a estimar lliurement. Encara que va ser criada amb valors diferents, reconeix que la societat ha canviat i celebra que el seu fill pugui ser feliç sent ell mateix.